Образовательный центр «Сириус» координирует проведение школьного этапа Всероссийской олимпиады школьников в 83 субъектах Российской Федерации по шести профильным для Сириуса естественно-научным дисциплинам — информатике, математике, физике, химии, биологии и астрономии. В 2025/26 учебном году в олимпиаде по этим предметам принял участие каждый третий школьник страны. Всего было написано свыше 7 млн работ.

Весной 2026 года прошёл пригласительный этап олимпиады по шести дисциплинам, координируемым Сириусом. Самыми массовыми предметами традиционно стали математика и биология. В пригласительном этапе могли принимать участие учащиеся 5–10 классов из России, школьники 9–18 лет из разных стран, учителя, родители и все желающие.

Кроме того, федеральная территория ежегодно принимает финалы Всероссийской олимпиады школьников по нескольким предметам. В 2026 году в Сириусе прошли заключительные этапы по химии, астрономии и праву.